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《徐霞客游记》的编辑整理和流传，除了徐霞客家的塾师季梦良的幼子李介立（徐霞客的小儿子，为徐霞客侍妾周氏所生）作出了很大贡献外，民间藏书家的珍藏、校订、增补，也是《徐霞客游记》得以保存和流传的一个重要因素。
《徐霞客游记》中涉及到生活中并不常见的名词：很多古地名、古民族名和古代历史遗迹。为此，后人不但对原文中的生僻字词进行了详尽的注释，对于原文中出现的一些古地名也追根溯源，在注释中将古地名的地理位置准确标示出来，减少了普通读者在阅读过程中对地理位置描述的困惑和障碍，更令读者在阅读过程中有一种身临其境之感。最后，后人按照整部书的风格选取了精美古朴的木版画，配合图说，或是概括性地介绍了书中出现的风景名胜，或是介绍徐霞客当年途经之处的人情风物，呈献给读者的不仅是文字上的享受，更有一种文化和艺术美感上的提升。
《徐霞客游记》对于地理学家是一份珍贵的地理科学报告，对普通读者而言，它更像是一本旅游指南，书中那一片片壮阔辽远的风景，一座座高峻雄伟的山峰，似乎正在催动我们渴望冒险的心，在攀登中获得乐趣，在探索中寻觅真知。
仅在中国广西、贵州、云南3省区，他亲自探查过的洞穴便有270多个，且一般都有方向、高度、宽度和深度的具体记载。并初步论述其成因，指出一些岩洞是水的机械侵蚀造成，钟乳石是含钙质的水滴蒸发后逐渐凝聚而成等。他是中国和世界广泛考察喀斯特地貌的卓越先驱。
调查了云南腾冲打鹰山的火山遗迹，科学地记录与解释了火山喷发出来的红色浮石的质地及成因；对地热现象的详细描述在中国也是最早的；对所到之处的人文地理情况，包括各地的经济、交通、城镇聚落、少数民族和风土文物等，也作了不少精彩的记述。 他在中国古代地理学史上超越前人的贡献，特别是关于喀斯特地貌的详细记述和探索，居于当时世界的先进水平。
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